Kromatinstrukturens betydelse i akut lymfatisk leukemi hos barn

Leukemi uppstår när en cell får förändringar (mutationer) i de gener (DNA) som styr celldelning och tillväxt. Genom att förstå vilka gener som är påverkade och hur de i sin tur påverkar cellen kan man utveckla nya läkemedel som både ger högre chans till bot och färre biverkningar. I detta projekt har vi studerat hur kromatinet – DNA samt associerade proteiner – är veckat i leukemiceller. Denna veckning styr i hög grad vilka gener som är aktiva och kan därför påverka hur leukemin utvecklas.

Vi har utfört så kallad Micro-C, en teknik för att studera hur kromatinet veckas, på prover från 36 barnleukemier från olika genetiska undergrupper. Detta är den i särklass största serien av barnleukemiprov som undersökts med denna metod. Vi fann många intressanta samband, bland annat att man kunde se att fall från samma genetiska subtyp hade liknande kromatinveckning. Vad gäller fall som hade extrakromosomer i leukemicellerna såg vi att de hade en avvikande veckning som också påverkade vilka gener som var aktiva, något som kan ha betydelse för leukemiutvecklingen. Vi kunde också identifiera loopar i kromatinet som reglerade specifika gener som vi vet har betydelse i leukemin. Sammantaget har studien lett till en förbättrad förståelse av hur gener (fel)regleras i barnleukemi och därmed till en djupare insikt i hur leukemi uppstår.

‍